Le département de formation continue est un bras important dans la mise en oeuvre de la vision de la FoDAB qui est de l'Endoscopie pour tous. A travers ce département, les prestataires de toutes les spécialités vont être formés pour une expansion effective de l'endoscopie en République Démocratique du Congo et en Afrique Centrale. Il constitue aussi une plate forme permettant aux spécialistes locaux et internationaux de partager leur expérience pour l'amélioration de la prise en charge des patients.
Actuellement ce département organise des fora pour emmener les spécialistes à partager leur expérience par des discussions scientifiques et ainsi pas seulement reveiller l'enthousiasme de plus d'un, mais aussi renforcer les capacités des uns et des autres.